Молекулалық биологияда STRING (Әрекеттесетін гендер/ақуыздарды іздеуге арналған іздеу құралы) – белгілі және болжамды ақуыз-белок әрекеттесулерінің биологиялық дерекқоры және веб-ресурсы. … 11b соңғы нұсқасында 5000-нан астам ағзалардың шамамен 24,5 миллион белоктары туралы ақпарат бар.
STRING дерекқорының мақсаты қандай?
STRING дерекқоры ағзалардың үлкен саны үшін белгілі және болжамды ақуыз – ақуыз байланысы деректерін біріктіру арқылы осы ақпаратты жинауға және біріктіруге бағытталған.
STRING ұпайы дегеніміз не?
STRING-те әрбір ақуыз-ақуыз әрекеттесуі бір немесе бірнеше «баллдармен» түсіндіріледі. Маңыздысы, бұл ұпайлар өзара әрекеттестіктің күшін немесе ерекшелігін көрсетпейді. Оның орнына, олар сенімділік көрсеткіштері, яғни STRING қолжетімді дәлелдерді ескере отырып, өзара әрекеттестіктің шынайы болуы қаншалықты ықтимал.
Неліктен белоктар өзара әрекеттеседі?
Ақуыз-ақуыз әрекеттесуі (PPIs) - бұл электростатикалық күштерді, сутегін қамтитын өзара әрекеттесу арқылы басқарылатын биохимиялық оқиғалар нәтижесінде екі немесе одан да көп ақуыз молекулалары арасында орнатылған жоғары ерекшеліктегі физикалық контактілер байланыс және гидрофобты әсер.
Функционалдық ассоциация дегеніміз не?
анықтамасы. Биологиялық нысандар арасындағы екілік қатынас олардың бірі екіншісін функция, экспрессия, деградация немесе екіншісінің тұрақтылығы және қарым-қатынас тұрғысынан модуляциялағандасеріктестер арасындағы тікелей анықтау мүмкін емес, сондықтан аралық қадамдар жанама түрде бар.
