BLAST бірнеше мақсатта қолданылуы мүмкін. Оларға түрлерді анықтау, домендерді анықтау, филогенезді анықтау, ДНҚ картасын жасау және салыстыру жатады. BLAST пайдалану арқылы түрді дұрыс анықтауға немесе гомологиялық түрді табуға болады.
BLAST не үшін қолданылады?
BLAST – Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығының (NCBI) веб-сайтында, сондай-ақ басқа да көптеген сайттарда онлайн пайдалануға болатын компьютерлік алгоритм. BLAST сұрау ДНҚ тізбегін реттіліктердің дерекқорымен жылдам туралайды және салыстыра алады, бұл оны үздіксіз геномдық зерттеулерде маңызды құрал етеді.
BLAST техникасы дегеніміз не?
BLAST әдісі - Альберт Барнето әзірлеген шағымды шешу әдісі . Мнемоника "Сену, тыңдау, кешірім сұрау, қанағаттандыру және алғыс айту" дегенді білдіреді (1-кесте). 6. Бұл мақала оның емделушілерді күтудегі және клиникалық оқыту құралы ретіндегі пайдалылығын сипаттайды.
BLAST ДНҚ қалай жұмыс істейді?
BLAST қалай жұмыс істейді? BLAST бастапқыда екі реттілік арасындағы қысқа сәйкестіктерді табатын эвристикалық әдіс арқылыгомологтық тізбектерді анықтайды; осылайша, әдіс барлық реттілік кеңістігін есепке алмайды. Алғашқы сәйкестіктен кейін BLAST осы бастапқы сәйкестіктерден жергілікті теңестіруді бастауға әрекеттенеді.
Неліктен BLAST Fasta-дан жылдамырақ?
Алгоритмнің орындалу уақытының күрделілігі тұрғысынан BLAST FASTA қарағанда жылдамырақ тек маңыздырақ үлгілерді іздеу арқылы реттері. BLAST және FASTA сезімталдығы (немесе дәлдігі) нуклеин қышқылы мен ақуыз тізбегі үшін әртүрлі болады (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
