Праймер димер артефактілері әдетте үлкен шекті цикл санында (әдетте > 35 цикл) болады, бұл қалаған ампликон үшін шекті цикл санынан жоғары. Гетерологиялық геномдық ДНҚ қосылғанда праймер димерлері айтарлықтай артады.
ДНҚ геліндегі праймер димерлерін қайдан көресіз?
Сандық емес соңғы нүкте ПТР-да праймер димер агарозды гельде азды-көпті әлсіз жағынды ретінде пайда болады, қызықты өнім диапазонынан төмен.
Праймер димерлері қалай түзіледі?
Праймер димерлері екі праймер бір-бірімен байланысқанда үлгі ДНҚ орнына, праймер комплементарлы аймақтарына байланысты түзіледі.
Праймер димерлерін қалай анықтауға болады?
Праймер-димерлер бар-жоғын тексерудің ең оңай жолы - теріс бақылауға (ДНҚ немесе РНҚ орнына су) реакцияларыңызды салыстыру. Теріс бақылауда праймер димерлері әлі де қалыптасады. Кейбір праймер жинақтары басқаларға қарағанда димерлерді құру ықтималдығы жоғары.
Неліктен праймер димерлері пайда болады?
Көбінесе праймер димерлері ПТР реакциясы қоспасындағы праймердің жоғары концентрациясына байланысты көрінеді. Немесе ПТР күшейту болмаса және агароздық гельдегі праймер димерінде көруге болады. ПТР өнімін көре алсаңыз, негізгі заттың концентрациясын азайтып, басқа шарттарды бірдей етіп сақтауға болады.
