Хромосома конформациясын анықтауға (3C) негізделген әдістер хроматинбойындағы жұп нүктелердің физикалық жақындығын анықтау арқылы ядродағы хромосомалардың ұйымын ашады. Олар өзара әрекеттесетін аймақтарды фрагментациялау, байлау және секвенирлеу арқылы кроматинді өзара байланыстыру арқылы сақтайды.
Хромосома конформациясы қалай жұмыс істейді?
Хромосома конформациясын чипте түсіру (4C) бір локус пен барлық басқа геномдық локустар арасындағы өзара әрекеттесулерді түсіреді. Ол кері ПТР орындау үшін пайдаланылатын өздігінен айналмалы ДНҚ фрагменттерін жасау үшін екінші байлау қадамын қамтиды. … Бір микромассивте шамамен миллион әрекеттесуді талдауға болады.
Хроматин конформациясын түсіру дегеніміз не?
Хроматин конформациясын түсіру (3C) - хроматин құрылымын зерттеу үшін пайдаланылатын маңызды әдіс, сондай-ақ бірнеше басқа туынды әдістердің негізі. … Хаттама жасушалардың формальдегидті айқаспалы байланысын, содан кейін хроматинді оқшаулауды және шектеу ферментінің көмегімен қорытуды қамтиды.
Hi-C реттілігі қалай жұмыс істейді?
Hi-C әдісі геном бойынша хроматин контактілерін картаға түсіру үшін 3C-Seq кеңейтеді және ол сонымен қатар in situ хроматин өзара әрекеттесулерін зерттеу үшін қолданылды. Бұл әдісте ДНҚ-ақуыз кешендері формальдегидпен айқаса байланысады. Үлгі фрагменттеледі және ДНҚ экстракцияланады, байланады және шектеу ферменттерімен қорытылады.
Hi-C техникасы дегеніміз не?
Классикалық Hi-C техникасы ретті шектеуші ферменттері бар формальдегидті айқаспалы геномды шектеуді қорытуды қамтиды, содан кейін сіңірілген ұштарды қосу арқылы толтыру және жөндеу биотинмен байланысқан нуклеотидтер. Жөнделген ұштары содан кейін қайта байланады.
