Арабиноза – табиғатта кең таралған бес көміртекті қант және көптеген бактерияларда жалғыз көміртегі көзі ретінде қызмет ете алады. Үш геннен алынған ақуыз өнімдері (araB, araA және araD) Enterobacteriaceae тұқымдасының E. coli және S. сияқты мүшелерінде арабиноза ыдырауы үшін қажет.
Арабиноза бактерияларға не береді?
Осылайша, арабиноза оперонын қосу үшін арабиноза болған кезде, GFP өндіріледі және бактериялар флуоресцентті болуы мүмкін. Арабинозасыз GFP гені экспрессияланбайды және флуоресценция болмайды. Сонымен, қоректік заттардың құрамын өзгерту арқылы зерттеуші трансформацияланған бактерияларда флюресценцияның қашан (және егер) пайда болатынын бақылай алады.
Арабинозаның бактериялық трансформациядағы рөлі қандай?
Арабиноза AraC аллостериялық реттеушісі ретінде әрекет етеді, ол қай ДНҚ учаскелерімен байланысатынын және димерді қалай түзетінін өзгертеді. Арабинозаның AraBAD опероны ақуыздары арқылы катаболизденетін қант екенін есте сақтаңыз. E. coli тіршілік ететін ортаға арабиноза қосылғанда, ол AraC-пен тығыз байланысады.
Арабиноза не үшін қолданылады?
Биологияда қолдану
Синтетикалық биологияда арабиноза көбінесе P bad астында ақуыз экспрессиясы үшін бір жақты немесе қайтымды қосқыш ретінде пайдаланылады. E. coli промоторы. Бұл қосу-қосқышты глюкозаның болуы арқылы жоққа шығаруға немесе катаболиттік репрессияның бір түрі болып табылатын қоректік ортаға глюкозаны қосу арқылы өзгертуге болады.
Қалайарабиноза бактериялардағы геннің реттелуіне және экспрессиясына әсер ете ме?
Арабиноза болған кезде, araC ДНҚ конфигурациясын босаңсытады, осылайша транскрипция орын алады, бірақ бұл көмірсулар болмаған кезде, бірдей ақуыз ДНҚ-ның байланысу қабілетін төмендету үшін шектейді. РНҚ полимеразасы бар.
